Synology oprócz wspomnianych wcześniej pakietów dysponuje bardzo bogatym zestawem dodatkowych aplikacji. W chwii obecnej możemy wybierać wśród kilkudziesięciu dodatkowych, a także dodawać alternatywne repozytoria. Aplikacje zgromadzone w Centrum pakietów zostały podzielone na grupy. Znajdziemy tu aplikacje webowe przeznaczone do użytku domowego i biznesowego, systemy serwerowe (DNS, DHCP, LDAP czy VPN). Producent dość duży nacisk położył także na aplikacje multimedialne a każdy użytkownik domowy znajdzie coś interesującego dla siebie. Coś, co pozwoli dopasować serwer do indywidualnych potrzeb. Jest zatem serwer iTunes centralizujacy muzykę i umożliwiający jej odtwarzanie na dowolnym komputerze wyposażonym w odtwarzacz iTunes. Możemy także skorzystać z trzech aplikacji do muzyki, zdjęć i filmów. Mowa tu o Audio Station, Photo Station oraz Video Station. To pakiety ze świetnie dopracowanym interfejsem WWW pozwalającym na odtwarzanie wszelkiego rodzaju materiałów multimedialnych. Stacja muzyczna umożliwia stworzenie biblioteki muzycznej i dostęp do niej z poziomu dowolnej przeglądarki internetowej.
W Audio Station możemy wyświetlać muzykę według określonych kryteriów, a także tworzyć listy odtwarzania. Aplikacja posiada funkcję odtwarzacza internetowych stacji radiowych. Możemy wybierać wśród listy predefiniowanych lub dodawać własne linki stacji. Dużym plusem aplikacji Audio, Video oraz Photo Station jest dostęp przy użyciu aplikacji mobilnych. Zarówno poprzez sieć LAN, jak i zdalnie z wykorzystaniem QuickConnect lub adresu IP. Audio Station pozwala także na odtwarzanie materiałów z odtwarzaczy DLNA znajdujących się w sieci LAN.
Podobną funkcjonalność posiada Video Station. Możemy w jednym miejscu zgromadzić wszystkie materiały filmowe. System zadba o opis filmów i uzupełnienie informacji o filmie. Materiał możemy odtwarzać przy użyciu przeglądarki internetowej lub też za pomocą aplikacji mobilnej. Dodatkowo Video Station może przerodzić się w cyfrowy system nagrań sygnału telewizyjnego. Wystarczy podłączyć kompatybilna kartę USB TV.
W porównaniu z poprzednią wersją dość mocno został zmieniony pakiet Photo Station. Wersja szósta systemu centralnej biblioteki zdjęć nabrała w końcu więcej lekkości i przejrzystości. Oprócz możliwości gromadzenia zdjęć w albumach (z możliwością tworzenia pokazu slajdów czy geotagowania zdjęć lub oznaczania osób) producent przygotował także możliwość prowadzenia fotobloga.
Uzupełnieniem świetnych aplikacji multimedialnych Synology nie zapomniał o menadżerze pobierania. Download Station również obsługujemy przy użyciu przeglądarki internetowej. Możemy także kontrolować pobierania przy użyciu aplikacji mobilnej. Menadżer pozwala także na dostęp zdalny oraz na dodawania odnośników bezpośrednio w oknie pobierania oraz pobieranie P2P np. z plików torrent.