Podczas pierwszego uruchomienia Thunderbird zaproponuje utworzenie konta. Można to także zrobić wybierając z menu "Narzędzia" opcję "Konfiguracja kont" i klikając "Dodaj konto". Pojawi się nowe okno. Należy wybrać "Konto pocztowe", potem wpisać imię i nazwisko oraz adres mailowy; podać nazwy serwerów POP (dla wiadomości przychodzących) oraz SMTP (dla wychodzących). Informacje te zawarte są zwykle na stronach pomocy dostawcy usług. Ostatni etap to wprowadzenie nazwy użytkownika (wzór podany w FAQ administratora) oraz ogólnej nazwy konta (dowolnej).
Wszystkie te dane można modyfikować. W polu po lewej pojawi się nowo utworzone konto wraz z opcjami. W "Konfiguracji serwera" włącza się szyfrowanie - jeśli administrator oferuje taką usługę. Warto ustawić częstotliwość sprawdzania nowej poczty na około 10-15 minut. Jeśli ze skrzynki korzysta kilka osób można aktywować pole "Pozostaw kopię wiadomości na serwerze / Przez X dni". W ten sposób inni użytkownicy mogą pobrać te same maile. Z kolei osoby, które zapominają o opróżnianiu kosza zapewne włączą automatyczne jego czyszczenie.
Pod "Tworzenie" można zdecydować, czy w ramach danego konta wiadomości mają być pisane przy użyciu kodu HTML czy zwykłym tekstem. Generalnie ta druga opcja jest milej widziana przez większość userów, więc dopóki maile nie muszą być estetyczne (np. zawierać graficznych nagłówków firmowych) lepiej korzystać z prostszej wersji. W "Niechcianej poczcie" należy upewnić się, że filtr spamu jest włączony. Na koniec można wrócić do głównej kategorii ustawień konta i włączyć sygnaturkę. Trzeba w tym celu utworzyć plik TXT z treścią - np. w 4 wersach "pozdrawiam / Jan Kowalski / tel: 600-123-456 / gg: 12345678". Po wskazaniu Thunderbirdowi tego zasobu będzie on automatycznie dodawał jego treść pod każdą wiadomość.
Oprócz tego w programie można zmieniać wygląd pasków narzędziowych. Wystarczy kliknąć prawym klawiszem w puste miejsce jednego z nich i wybrać "Dostosuj". Pojawi się nowe okno z dostępnymi a nieużywanymi przyciskami. Aby z nich korzystać, wystarczy chwycić je myszą i upuścić obok istniejących skrótów. Usuwanie przeprowadza się odwrotnie. Możliwe jest także przenoszenie buttonów między paskami narzędziowymi. Da się nawet umieścić wszystkie przyciski i pola wyszukiwania na prawo od tradycyjnego menu, a następnie w "Widok" / "Paski narzędzi" odznaczyć opcję "Pasek narzędzi poczty". Dzięki temu użytkownik zyskuje więcej miejsca na właściwe wiadomości.
Migracja między komputerami
Największą wadą tradycyjnych klientów jest brak możliwości przeglądania poczty z każdego komputera podłączonego do sieci. Kłopot ten można jednak częściowo rozwiązać. Wystarczy włączyć w Thunderbirdzie opcję "Pozostaw kopię wiadomości na serwerze/Dopóki wiadomość nie zostanie usunięta". W ten sposób maile nadal będą dostępne online. Niektóre usługi - jak Gmail - zapisują nawet elementy wysłane, nie tylko odebrane.
Jeśli użytkownik zmienia komputer i nadal chce mieć lokalny dostęp do archiwów nie musi pobierać ich ponownie na dysk. Wystarczy nagrać na płytę CD czy DVD zawartość katalogu C:\Documents and Settings\nazwa użytkownika\Dane aplikacji\Thunderbird, a następnie skopiować go na nową maszynę (po instalacji programu, nadpisując wszystkie znajdujące się tam pliki - jeśli nie będzie to możliwe, trzeba zrestartować komputer i dokonać modyfikacji przed ponownym uruchomieniem klienta poczty). Ta procedura przeniesie nie tylko archiwalne maile, ale także układ katalogów, filtry wiadomości oraz konfigurację kont (włącznie z hasłami).
